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Protidi

I peptidi (talvolta definiti protidi) sono costituiti da amminoacidi.
Un generico amminoacido ha formula

H2N-CH(R)-COOH

dove R indica la catena laterale, ossia la parte di molecola che distingue tra loro gli amminoacidi normalmente presenti nei peptidi

Gli amminoacidi si uniscono attraverso il legame peptidico, la cui formazione avviene come descritto qui di seguito attraverso un processo di disidratazione(perdita di una molecola d'acqua):

H2N-CH(R1)-COOH + H2N-CH(R2)-COOH --> H2N-CH(R1)-CO-HN-CH(R2)-COOH + H2O
.

Brevi catene di amminoacidi, gli oligopeptidi, servono a trasportare segnali chimici. Catene piů lunghe sono dette polipeptidi: le proteine sono polipeptidi naturali, per la cui composizione sono utilizzati solo 20 differenti amminoacidi (detti naturali)

La sintesi dei polipeptidi può avvenire a livello industriale(e di tecniche di laboratorio)per due vie distinte:

1. Sintesi di Merrifield (o in fase solida): i polipeptidi vengono sintetizzati utilizzando un supporto solido polimerico a cui vengono legati in successione dal primo amminoacido, che viene solitamente utilizzato opportunamente modificato affinchč si leghi alla resina e sia protetto durante la sintesi dai reagenti utilizzati.

2. Sintesi enzimatica: vengono utilizzati opportunamente enzimi che possono promuovere la formazione e/o la rimozione di un legame peptidico(chimotripsina, tripsina, elastasi, pepsina, etc.)

Le proteine sono sintetizzate dagli organismi attraverso il processo della biosintesi

Table of contents
1 Le proteine

Le proteine

Funzioni

Un’utile suddivisione delle proteine distingue in base alla funzione.

Le proteine strutturali sono componenti delle strutture permanenti dell’organismo ed hanno principalmente una funzione meccanica. Due esempi sono il collagene e l’elastina, presenti nella matrice dei tessuti connettivi.

Le proteine di trasporto si legano (in genere con legami deboli) a sostanze poco (o comunque non abbastanza)idrosolubili e ne consentono il trasporto nei liquidi corporei. Comprendono ad esempio le proteine del sangue che trasportano i lipidi e il ferro, nonché l’emoglobina che trasporta l’ossigeno. Molto importanti sono anche le proteine di trasporto delle membrane cellulari, che permettono un passaggio selettivo di molecole idrosolubili e ioni.

Le immunoglobuline (dette anche anticorpi) sono proteine che si legano a molecole normalmente non presenti nell’organismo, concorrendo alla difesa dello stesso.

Gli enzimi sono proteine catalitiche. Essi accelerano enormemente la velocitĂ  di specifiche reazioni chimiche, determinando quali, tra le pressochĂ© infinite reazioni che potrebbero avvenire tra le sostanze presenti, avvengono realmente a velocitĂ  apprezzabile. Di fatto, ogni molecola appena un po’ complessa presente in un essere vivente č prodotta da enzimi.

Struttura

La sequenza ordinata degli amminoacidi che formano un polipeptide č la sua struttura primaria. Essa determina la struttura secondaria, ossia il modo in cui gli amminoacidi di ogni breve sezione della proteina si dispongono nello spazio, a seguito di legami deboli tra di loro e con l’ambiente (generalmente acquoso). Amminoacidi anche molto distanti nella sequenza interagisco o meno tra di loro e con il mezzo, determinando la struttura terziaria, ossia la “forma” generale del polipeptide. Due amminoacidi non troppo vicini possono, in certi casi, legarsi covalentemente, mediante un ponte disolfuro (-S-S-). Se una proteina č formata da due o piů polipeptidi (detti subunitĂ ) essi sono uniti tra loro da legami deboli (e a volte ponti disolfuro) in un modo molto specifico. In questo caso la proteina possiede anche una struttura quaternaria. Alcune proteine contengono anche una parte non proteica, detta gruppo prostetico.


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